Анализа пристрасности употребе кодона хлоропластног генома Цистанцхе

Апстрактан:

Циљ Разјаснити пристрасност употребе кодона и факторе утицаја на геном хлоропласта у четири лековите биљке Цистанцхе спп. Методе Параметри пристрасности употребе кодона одЦистанцхе десертицола, Цистанцхесалса иЦистанцхетубулосаанализирали су ЦУСП, ЦодонВ 1.4.2, СПСС и Мицрософт Екцел.

Резултати Геноми хлоропласта четири врсте Цистанцхе имали су сличне обрасце употребе кодона, при чему се трећа база кодона завршава на А/Т и има тенденцију да користи А/Т базе повољније.

Вредности ЕНЦ (ефикасног броја кодона) за четири врсте су биле изнад 35, што указује да је кодонска преференција гена хлоропласта у Цистанцхе спп. слаб је. Резултати дијаграма неутралности, ЕНЦ-графикона, ПР2- дијаграма пристрасности и анализе кореспонденције показали су да је природна селекција главни фактор који утиче на пристрасност употребе кодона хлоропластног генома код Цистанцхе спп. РСЦУ (релативна синонимна употреба кодона) вредности су коришћене за идентификацију четири оптимална кодона које деле четири врсте Цистанцхе спп.

Закључак У овој студији анализирали смо пристрасност употребе кодона генома хлоропласта четири врстеЦистанцхе тубулоса. и открили факторе утицаја који утичу на пристрасност кодона, што је дало одговарајућу теоријску основу за проучавање систематске еволуције, адаптације животне средине и побољшања расеЦистанцхена молекуларном нивоу.

Кликните овде да бисте добили екстракт Цистанцхе Тубулоса

Тражи више:

Имејл:wallence.suen@wecistanche.com Вхатсапп плус 86 15292862950

Цистанцхе Хоффманнс. & Линк је вишегодишња паразитска биљка из породице Оробанцхацеае, углавном распрострањена у Европи и Азији, са четири врстеЦистанцхеу Унутрашњој Монголији, Нингсији, Гансуу, Ћингају и Синђангу [1].

Међу њима,Цистанцхе десертицола Маима највећу лековиту вредност и познат је као „пустињски гинсенг“ јер расте углавном у пустињским пределима. Међутим, лековите биљке из рода Цистанцхе суочавају се са забуном у класификацији биљака [2] и забуном у употреби комерцијално доступних врста [3]. Хлоропласти су место фотосинтезе у већини зелених биљака, укључени су у развојне и секундарне метаболичке активности [4] и координирају експресију гена између органела и нуклеарног генома [5]. Хлоропласти имају аутономно наслеђен геном и широко се користе у студијама као што су филогенетска анализа биљака, идентификација врста и изражавање генетске разноврсности. Последњих година, са сазревањем технологије секвенционирања високе пропусности генома хлоропласта, неколико биљака из рода Цистанцхе, Цистанцхе салина Ц. салса (ЦА Меи.) Г. Бецк, Цистанцхе салса Ц. синенсис Г. Бецк и Цистанцхе тубулоса Вигхт су били подвргнути студијама секвенцирања хлоропласта, и њихове филогеније и генетике. Међутим, ниједна студија о преференцији кодона хлоропластног генома Цистанцхе спп. је пријављено.

Кодон, такође познат као генетски код, је мост између нуклеинских киселина и протеина. мост између нуклеинских киселина и протеина, и важан је за препознавање и пренос биолошких генетичких информација, кодони, такође познати као генетски код, важни су вектори за препознавање и пренос биолошких генетичких информација и кључни су део у биолошком наслеђу и варијацији [8 ].

Због разлика у процесу транслације протеина међу врстама, постоји тенденција да се користи један или процес транслације различитих врста, они имају тенденцију да користе један или више специфичних синонимних кодона Овај феномен се назива пристрасност употребе кодона (ЦУБ) [9]. Овај феномен се назива пристрасност употребе кодона (ЦУБ) [9], а преференција кодона има значајан утицај на транслацију мРНК, транскрипцију ДНК, структуру протеина, експресију и експресију. преференција кодона игра важну улогу у транслацији мРНА, транскрипцији ДНК, структури протеина, експресији, функцији и ко-транслационом савијању и другим ћелијским метаболичким процесима. Преференција кодона игра важну улогу у ћелијским метаболичким процесима као што су транслација мРНК, транскрипција ДНК, структура протеина, експресија, функција и ко-транслационо савијање [10]. Схи Иансхуо и сарадници [11] анализирали су преференцију кодона четири врсте Панак гинсенга анализом преференције генома хлоропласта четири Панак Линн. анализом преференције кодона хлоропластних генома четири Панак Линн. биљке и закључио да су биљке у истом роду ближе међусобно повезане. Сонг Иун и сарадници [12] су показали да се ген ИЦЕ1 може оптимизовати на основу преференције кодона, чинећи га отпорнијим на стрес при ниским температурама.

Сонг Иун и сарадници [12] су показали да ИЦЕ1 ген може бити оптимизован за експресију под ниским температурним стресом на основу преференције кодона; Ли Ксианхуанг и сарадници [13] су открили да су Ли Ксианхуанг и сарадници [13] открили да преференција кодона може одражавати еволуционе односе међу врстама; Зханг Јун Иан Ли и сарадници [13] су открили да преференција кодона одражава еволуциони однос између врста; Јун Иан Зханг и сарадници [14] су показали да мутација и природна селекција заједно утичу на експресију Свертиа бимацулате (Л.). Зханг Јуниан и сарадници [14] су показали да мутација и природна селекција у комбинацији утичу на еволуциони однос Свертиа бимацулате (Сиеб. ет Зуцц.) Хоок. ф. ет Тхомс. ек ЦБ Цларк геном хлоропласта преференција кодона за свертиа бимацулате (Сиеб. ет Зуцц.) Хоок. ф. ет Тхомс. Проучавање преференција геномских кодона хлоропласта у геномима хлоропласта биљака спроведено је да би се обезбедила основа за припитомљавање швеђана. Стога, проучавање образаца употребе кодона генома биљних хлоропласта може пружити основу за припитомљавање швеђана. Стога, проучавање образаца употребе кодона генома хлоропласта може помоћи у побољшању ефикасности изградње вектора експресије гена, молекуларних механизама адаптације на животну средину и побољшања биљних сорти. Стога, проучавање образаца употребе кодона генома биљних хлоропласта може пружити подршку подацима за побољшање ефикасности конструкције вектора експресије гена, истраживање еволуционих односа врста, разумевање молекуларних механизама адаптације на животну средину и побољшање биљних врста [15].