Студија мрежне фармакологије о естрогеном утицају гликозида Цистанце Десертицола

 

Сажетак

Ова студија истражује потенцијални механизам ефеката естрогенихгликозиди одЦистанцхе Десертицола(ГЦС)На основу мрежне фармакологије у комбинацији са транскриптским подацима. Укупно40 активних састојакаГЦС са естрогеним ефектима предвиђено је коришћењем база података као што суТцмсп, Симпатичан, Етцм, УбодиКсар.

Циљне информације о болестима естрогене недостатке преузете су изГенеЦардсиОмимБазе података. Кључни циљеви су прегледани и аППИ мрежаје изграђен.Идите функционално анализу обогаћивањаиАнализа обогаћивања путем КЕГГ-аспроведене су да идентификују кључне циљеве и путеве.

У комбинацији са прелиминарним транскриптским подацима, анализа корелације између мрежних фармаколошких циљева и стаза КЕГГ-а извршена је да додатно открије механизам естрогене ефекта ГЦС-а.

183 циљевасу прегледани и1.712 циљеваизабрани су за болести недостатка естрогена.

24 ЦОРЕ КЉУЧНЕ ГИТОВЕдобијени су.

Иди функција и обогаћивање путем КЕГГ-а показало је да ГЦС углавном дјелују о биолошким процесима као што су:

Везање цитокина рецептора

Везање рецептора естрогена

Везање рецептора фактора раста

Активност нуклеарне рецептора

Везивање рецептора за нуклеарни хормон

Активност рецептора стероида хормона

Везивање хормона рецептора

Регулаторни путеви укључују:

Фактор некрозе тумора (ТНФ) сигнализациони пут

Интерлеукин -17 (ил -17) сигнализирајући пут

Хипоксија-индуцибилни фактор -1 (хиф -1) сигнализирајући пут

Естроген сигнализациони пут

Измене експресије гена откривене су у свему24 основне циљевеосимМцл1иГЦГ. Укључени су различито изражени гениАр, ЦАСП8, ЕСР1, ФосиХмок1. Укупно68 КЕГГ ПАТХСЕсу идентификовани, саЕстроген сигнализациони пут, Камп сигнализациони путиТНФ сигнализациони путбити главне путеве.

Закључак

Гликозиди одЦистанцхе ДесертицолаМоже да врши ефекте сличне естрогеном кроз "вишекомпонентни, вишеструки, више-стаза". Овај механизам може бити повезан са регулацијом:

Естроген сигнализациони пут

Камп сигнализациони пут

ТНФ сигнализациони пут

 

 

 

Уместо таблета за природне цистанце уместоЕстромиметички

ВхатсАпп нас за више детаља

 

 

Кључне речи

Гликозиди одЦистанцхе Десертицола

Естромиметички

Мрежа фармакологија

Транскрипт

Заједничка анализа

 

Естрогенје суштински хормон у развоју женског репродуктивног система и секундарних сексуалних карактеристика, играње пресудне улоге у регулисању женске плодности и родне особине [1]. Након уласка у менопаузу, жене доживљавају пад јајника, што је довело до смањене производње естрогена, што заузврат узрокује низ услова попут остеопорозе, атеросклерозе, менопаузалног синдрома и коронарних срчаних болести [2]. Традиционална терапија за замену естрогена може ублажити или смањити симптоме узроковане недостатком естрогена, али овај третман може такође довести до потенцијалних нуспојава [3]. Студије су показале да дуготрајно коришћење естрогена може резултирати прекомерним пролиферацијом ендометријума, фиброида материце и хиперплазије млечне жлезде, између осталих штетних ефеката. Отуда, тражење ефикасног, сигурног и практичног третмана за побољшање нивоа ниске естрогене је од великог значаја и вредности [4].

Биљни естрогени су супстанце способне да врше активности налик естрогену. Њихова молекуларна структура је слична употреби сисара, која им омогућава да се посебно везују за естрогене рецепторе и дају благе ефекте сличне естрогену [5]. Истраживање указује да биљке естрогене имају различите фармаколошке ефекте, укључујући антитеопорозу и измену метаболичких поремећаја [6].

Цистанцхе Десертицолаје сушено, меснато стабљика са љуским листовима постројења ОробанцхацеаеЦИСТАНЦХЕ ДЕСЕРТИЦОЛА ИЦ МА. Има функције као што су тонирани ианг бубрега, обогаћујући суштину и крв и влажење црева да би се ублажила опстипација. Обично се користи за лечење недостатка, суштине и недостатка крви, немоћи, неплодност, неплодност, бол и слабост струка и колена и затвор проузрокована цревним сувошћу [7]. Претходне студије истраживачке групе потврдиле су да су тотални гликозидиЦистанцхе Десертицола(ГЦС), са садржајем већег од 60% ехинацозида, да ли су главне активне компоненте одговорне за његове ефекте сличне естрогену. ГЦС значајно повећавају коефицијент материце и висину епителних ћелија ендометрија у незрелим пацовима. Резултати транскриптска анализа показали су да ГЦС врши ефекте сличних естрогенима кроз 2.953 различито изражене гене, од којих је 1.475 било уверење и да је 1,478 смањено. Ови гени су углавном повезани са реаговањем естрогена, позитивну регулацију метаболичких процеса азота, развојне процесе и регулацију биолошког процеса. Првенствено учествују уЕстроген сигнализациони пут, Камп сигнализациони пут, Рап1 сигнална стазаиПут за сигнализацију МАПК-а [8-9].

Традиционална кинеска медицина (ТЦМ) Мрежна фармакологија може да истражује механизме ТЦМ-а у третману болести скринињом ТЦМ компоненти, предвиђајући циљне протеине активних компоненти и анализирање сигналних стаза укључених у ове циљне протеине [10-12]. Даље откривају механизам ефеката ГЦС-а у облику естрогена, ова студија запошљава анализу биоинформатике засноване на претходним транскриптским подацима Групе како би открила могући механизам који је укупногликозиди одЦистанцхе Десертицола Повећајте ефекте сличне естрогену.

1. Експерименталне базе података и софтвер

Тцмсп: хттп: //лсп.нву.еду.цн/тцмсп.пхп

Симпатичан: хттпс: //ввв.симмап.орг

Етцм: хттп: //ввв.нрц.ац.цн:9090/етцм/

Убод: хттп: //ститцх.ембл.де/

Ксар: хттп: //таргетнет.сцбдд.цом/

Пубцхем: хттпс: //пубцхем.нцби.нлм.них.гов

Унипрот: хттп: //ввв.унипрот.орг/

ГенеЦардс: хттп: //ввв.генецардс.орг/

Омим: хттпс: //ввв.омим.орг/

Нагнути: хттпс: //стринг-дб.орг/

Кегг: хттпс: //ввв.кегг.јп/

Ићи: хттп: //генеонтологи.орг/

Р језик: Рк 64 3. 5.3 Следећим пакетима:

ВЕННДИАГРАМ

цоунт.р

КластерПрофилер

орг.хс.ег.дб

симбол2ид

Перл Сцрипт: аддсимбол.пл

Цитоскапе: Верзија 3.7.1

 

2 експерименталне методе

2.1 Мреже фармакологије Предвиђање ГЦС-овог механизма налик естрогену

2.1.1 Предвиђање циљева ГЦС-ових главних активних компоненти

Помоћу УПЛЦ / К-ТОФ-МС анализе, 40 једињења са фармаколошким активностима налик естрогену [13] идентификовано је [13]. Ове једињења су претраженаТцмсп, СимпатичаниЕтцмбазе података за проналажење потенцијалних циљева гена за свако једињење. Поред тога, уведене су једињене структуре осмехаУбодиКсарбазе података за прикупљање циљева. Сви прикупљени циљеви су спојени, а дупликати су уклоњени да би добили потенцијалне циљне протеине.

2.1.2 Информације о циљевој бази података налик естрогену

Кључне речи "недостатак естрогена" коришћени су за тражење релевантних циљева уГенеЦардсиОмимБазе података.

2.1.3 Изградња "Активно једињење - језгра циља - Естроген-ова"

КористећиВЕННДИАГРАМПаковање у Р-у, раскрсница мета из оба извора била је нацртана као венн дијаграм. Подаци о интеракцији о интеракцији кандидата протеина су уверениЦитосцапе в3.9.1и идентификовани су основни циљеви. Одабране су одговарајуће једињења основних циљева, а мрежа "Јеличина - основна циља - естрогена" визуелно је анализирана и изграђена коришћењемЦитосцапе в3.9.1.

2.1.4 Изградња ППИ мреже

Основне циљне информације су увезене уНагнути database, selecting the species "Homo sapiens" and setting the confidence score to >0. 7 Да бисте конструисали мрежу интеракције протеина-протеина (ППИ). Тхецоунт.рПаковање у Р-у је коришћен за анализу и одабир топ 20 основних гена са највишим повезивањем међу основним циљним протеинима, који су били визуализовани.

2.1.5 Иди функционално анализа обогаћивања и анализа обогаћивања КЕГГ-а

За основне циљне гене, потражите базе података и базе података КЕГГ-а користећи Р пакетеорг.хс.ег.дб, симбол2идиКластерПрофилер. Топ 20 путева са исправљеним П-вредностима визуализују се као бар графикони, анализирајући значајне функционалне напомене и путеве обогаћене основним циљевима ефеката на сличним ГЦС-овим естрогенима.

2.2 Интеграција са транскриптским подацима

2.2.1 Анализа корелације између предвиђених циљева и транскриптаних гена

Пошто је врста у мрежном фармаколошком предвиђању људски, циљеви су претворени у хомологне гене пацова користећиХгнцпутем функције "Алатке-ХЦОП". Нивои диференцијалних гена израза анализирани су између ГЦС групе и контролне групе у транскриптом секвенцирању [9].

 

2.2.2 Анализа корелације између предвиђања мрежних фармаколошких и транскрипција КЕГГ путева

Основни циљни гени који су предвиђени мрежном фармакологијом (претворени у хомолошке гене за пацове) претражени су у бази података КЕГГ користећи Р пакетебиопродукториКластерПрофилерзаједно саид2симбол.плСцрипт. Врста је била ограничена на "Рно" и путеве са падјустом <0. 05 су прегледани. Венн Анализа је извршена да се идентификује путеве преклапања између КЕГГ путева обогаћених кроз мрежне фармаколошке предвиђања и транскриптенски експерименти у вези са ГЦС 'Естрогеним ефектима.