Механизам Херба Цистанцхес-Епимедиум Херб-Фортуне'с Дринариа Рхизоме у лијечењу остеопорозе на основу мрежне фармакологије и молекуларног спајања

Апстракт:

Циљ Проучити механизам херба цистанцхес -епимедиум херб -ризом дринарије среће на остеопорозипо мрежној фармакологији.

Методе. Фармаколошка база података и платформа за анализу система традиционалне кинеске медицине (ТЦМСП) коришћена је за проналажење главних компоненти и циљевахерба цистанцхес-епимедиумхерб-фортуне'с дринариа рхизоме, а Геен Цардс база података је коришћена за проналажење циљних гена остеопорозе. Венни2.1.0 је коришћен за узимање укрштања гена, база података низова је коришћена за интеракцију протеинаанализа мреже, Цитосцапе је коришћен за конструисање мрежног дијаграма активност-компонента-циљ, Давид база података је коришћена за анализу ГО обогаћивања, а КЕГГ анализа путање и извршено је молекуларно спајање.

Резултати У херби је било 46 ефикасних компонентици-станцхес-епимедиумхерб-фортуне'с Дринариа рхизоме анд225 цоммон таргетс витхостеопороза. суцхилацтоне, кверцетин, лутеолин, кемпферол, ериодиктиол, ериодиктиол и нарингенин су биле кључне компоненте, АКТ1, ЕРС2, ММП-9, АР и мТОР су биле кључне мете. Обогаћивање ГО показало је 489 биолошких процеса (БП), 53 ћелијске компоненте (ЦЦ) и 100 молекуларних функција (МФ). Резултати КЕГГ-а су показали да је добијено 149 путева рака, сигналних путева ПИ3К-Акт, сигналних путева естрогена итд. Резултати молекуларног спајања су показали да се ММП -9 може добро везати за сусилактон, кверцетин, лутеолин и кемпферол.

 ХЕРБА ЦИСТАНЦХЕ-ЕПИМЕДИУМ СИРОВИНЕ НА ПРОДАЈУ

ЗакључакХерба цистанцхес-епимедиум херб-фортуне'сДринариа рхизоме има вишециљни ефекат наостеопороза. Ефикасне компоненте лека могу регулисатициљеви повезани са остеопорозомса више путева за лечење остеопорозе.

Кључне речи: Херба цистанцхе; Епимедиум херб; Фортуне'с Дринариа рхизоме; Мрежна фармакологија; Молецулар доцкинг; Механизам деловања

остеопороза (ОП)је аметаболичка болест костијукарактерише системски губитак коштане масе и неравнотежаостеобластии остеокласти.

Клиничке манифестације сусмањена густина костију,повећана крхкост костију, и лаки преломи. Инциденција ОП значајно расте са годинама. Студије су показале да је стопа инциденције ОП код особа испод 50 година 15% до 50%, док се код старијих од 60 година стопа инциденције повећава на више од 56%. Различити клинички симптоми изазвани ОП озбиљно су утицали на здрав живот старијих особа.

Савремена медицина и даље има одређена ограничења улечење ОП, исинтетичке дрогетакође имају одређененефротоксичност. Традиционална кинеска медицина игра све важнију улогу у лечењу болести као што је ОП, укључујући епимедиум, цистанцхе и друге кинеске биљне лекове. Међу њима, Рехманниа глутиноса има специфичну агонистичку активност канабиноидног типа 2 рецептора (ЦБ2Р) и може се регулисати преко ЦБ2Р. Функције остеобласта и остеокласта [1]. Епимедиум и Цистанцхе десертицола имају ефекат тонизирања бубрега и обнављања есенције и често се користе у комбинацији са другим биљним лековима за лечење ОП. Ова студија користимрежна фармакологијаметоде за истраживање потенцијалних циљеваЦистанцхе десертицола-Епимедиум-Дринариаеза лечење ОП, и разјашњава његове путеве, путеве, молекуле итд. који делују на ОП, са циљем даљег развоја ОП терапеутских лекова у клиници. Дајте нове идеје.

1 Материјали и методе

1.1 Извори података

Мрежне фармаколошке базе података и софтвер укључени у ову студију укључују ТЦМСП базу података (хттпс://олд.тцмсп-е.цом/), базу података Пубцхем (хттпс://пубцхем.нцби.нлм.них.гов), швајцарску базу података за предвиђање циљева (хттп://свисстаргет-предицтион.цх/), Венни2 (хттпс://биоинфогп.цнб.цсиц.ес/тоолс/венни/индек.хтмл), Метасцапе (хттпс://метасцапе.орг) и Цитосцапе в3 .9.0 софтвер (хттпс://цитосцапе.орг/).

 ХЕРБА ЦИСТАНЦХЕ-ЕПИМЕДИУМ СИРОВИНЕ НА ПРОДАЈУ

1.2 Методе

1.2.1 Скрининг активних састојака и циљева лекова

ТЦМСП база података фармаколошке базе података и платформе за анализу система кинеске медицине коришћена је за претрагу састојака лекова са кључним речима Дринариа, Епимедиум и Цистанцхе десертицола. Главни састојци лекова су тестирани са условима оралне биорасположивости (ОБ) већим или једнаким 30% и вредности својства лека сличног једињењу (ДЛ) већом или једнаком 0,18. Циљеви који одговарају сваком састојку пронађени су на основу базе података ПубЦхем и базе података Свисс Таргет Предицтион. Циљеви болести су преузети на основу Геен Цардс базе података са остеопорозом као предметном речју.

1.2.2 Изградња ППИ мреже и скрининг језгра циља

Гени укрштања мета болести и лекова су добијени коришћењем Венни2.1.0, а дијаграм мреже ППИ је конструисан коришћењем Стринг софтвера. Мрежни дијаграм ППИ је увезен у Цитосцапев3.9.0 да би се прегледали главни циљеви и конструисала мрежа састојак лек-циља-болест. 1.2.3 Обогаћивање ГО и анализа КЕГГ путања Да би се истражила улога Цистанцхе десертицола, Епимедиум и Дринариае у лечењу ОП, кључне мете су унете у Давидову базу података, а врста је ограничена на "Хомо сапиенс" за ген ГО. обогаћивање и анализа КЕГГ пута. Најзначајније обогаћене ставке као што су ћелијски састав (ЦЦ), биолошки процес (БП), молекуларна функција (МФ) и КЕГГ су прегледани и увезени у микробиолошке информације за визуелну анализу.

1.2.4 Молекуларно спајање Хемијска структура главне мете је преузета на основу ПДБ базе података и сачувана у ПДБ формату. 3Д структура основне компоненте је преузета помоћу ПубЦхем базе података. Пимол софтвер је коришћен за уклањање воде и лиганада малих молекула. Аутодоцк софтвер је коришћен за молекуларно спајање и израчуната је енергија везивања.

2 Ресултс

2.1 Активни састојци лека – мете и циљеви болести

Укупно 46 активних састојака добијено је преко ТЦМСП базе података, укључујући 22 главна састојка Епимедиум, 18 активних састојака Дринариа фортунеи и 6 активних састојака Цистанцхе десертицола, као што је приказано у табели 1.

2.2 Укрштање мета лекова и мета болести Укрштање гена добијених коришћењем Венни софтвера

Укупно има 225 гена, као што је приказано на слици 1. Међу њима су 274 мета за лекове и 3093 мета болести.

2.3 Изградња и анализа ППИ мреже

Мрежа протеина је успостављена преко Стринг базе података, а језгра циљна мрежа је добијена скринингом језгра.

Као што је приказано на слици 2, добијено је 51 чвор и 704 интеракције. Првих 5 циљева рангираних по вредности степена су МАПК3, АКТ1, ТНФ, ЕГФР и СРЦ.

2.4 Изградња мреже лек-састојак-мета-болест

Циљна болест састојка лека је увезена у софтвер Цитосцапе, а подаци су анализирани да би се конструисао мрежни дијаграм (видети слику 3). Међу њима, број чворова главних састојака као што су МОЛ005384 (сухилактон), МОЛ000098 (кверцетин), МОЛ000006 (лутеолин), МОЛ000422 (кемпферол), МОЛ005190 (ериодиктиол), МОЛ002914 (Ериодиктиол), МОЛ002914 (Ериодиктиол), МОЛ002914 (Ериодиктиол), МОЛ002914 (Ериодиол), био је значајно (МОЛ002914 (Ериоди)402) већи од осталих састојака. Главни циљеви су АКТ1, ЕРС2, ММП-9, АР, мТОР итд.

2.5 ГО анализа обогаћивања и анализа КЕГГ пута

Анализа обогаћивања ГО је извршена на 51 мети језгра, а резултати анализе су добили 489 БП, 53 ЦЦ и 100 МФ. Првих 15 ставки сваког поређења коришћено је да се направи мапа обогаћивања ГО, која је укључивала биолошки процес позитивне регулације транскрипције промотора РНК полимеразе ИИ, негативну регулацију апоптозе, ћелијске компоненте макромолекуларног комплекса, компоненте митохондријске ћелије, молекуларне функције које везују протеин киназу, и молекуларне функције проксималног региона промотера језгра РНК полимеразе ИИ специфичне за секвенцу ДНК, као што је приказано на слици 4.

КЕГГ резултати су показали да је добијено 149 сигналних путева, укључујући пут рака, ПИ3К-Акт сигнални пут, сигнални пут естрогена, ХИФ-1 сигнални пут, итд. 20 најбољих путева је коришћено за израду КЕГГ анализе (видети Слика 5).