Потенцијал фенилетаноидних гликозида из Херба Цистанцхес против Оецуар Лиееанисн

Хепатоцелуларни карцином: заснован на мрежној фармакологији и молекуларном повезивању ЗХАНГ Јиавеи', ВЕН Лимеи? , ХУ Јунпинг', ИАНГ Јианхуа? (1 Цоллеге оф Пхармацеутицал Сциенцес, Ксињанг Медицал Университи, Урумки 830054, Кина; 2 Департмент оф Пхармацеутицалс, Фирст Аффилиатед Хоспитал оф Ксињианг Медицал Университи, Урумки 830011, Кина)

Абстрацт

Циљ: Истражити потенцијалмолекуларни механизам фенилетаноидних гликозидаизХерха Цистанцхес (ЦПхГс)против хепатоцелуларног карцинома (ХЦЦ) кроз мрежну фармакологију и молекуларно спајање. Методе: Активни састојци и потенцијални циљеви ЦПхГ-а су преузети из „Тхе Традитионал Цхинесе Медицине Системс Пхармацологи Датабасе анд Аналисис Платформ('ТЦМСП) и других база података и литературе, а циљеви који се односе на ХЦЦ из „Тхерапеутиц Таргет Датабасе('ТТ), Генецардсанд друге базе података. Тиме су добијене заједничке мете ЦПхГ-а и болести и конструисана је мрежа интеракције протеин-протеин (ППл) да скринингује кључне мете. Кључни циљеви су увезени у ДАВлД за обогаћивање генске онтологије (ГО) и обогаћивање путева Кјото енциклопедије гена и генома (КЕГГ). Коначно, АутоДоцк вина је коришћена за молекуларно спајање главних активних састојака и кључних циљева. Резултати: Укупно 29 активних састојака у ЦПхГ је скринирано, укључујући 410 циљних гена. Сигнални путеви директно повезани са лечењем ХЦЦ су билисигнални пут рака, протеогликан рака. пут, сигнални пут фосфатидилинозитол 3-киназе-протеин киназе Б (Пл3К-Акт), сигнални пут фактора раста васкуларног ендотела (ВЕГФ), итд. „Резултати молекуларног спајања показују да су тестирани протеини циљног рецептора имали висок афинитет везивања за активни састојци. Закључак: ЦПхГ могу регулисати ћелије рака, ангиогенезу и друге кроз више компоненти, више мета и вишеструких путева, вршећи на тај начин терапеутске ефекте на ХЦЦ.

Кључне речи ; Хепатоцелуларни карцином; Мрежна фармакологија; Молекуларни доц.кинг,цистанцхе

ЕКСТРАКТ ЦИСТАНЦХЕ ЗАЗАШТИТА ЈЕТРЕ

Примарни карцином јетрер је један од малигних тумора са високим морбидитетом и морталитетом у свету, а стопа преживљавања у року од 5 година износи свега 7% [1]. Хепатоцелуларни карцином (ХЦЦ) је најважнији патолошки тип, који чини више од 85% [2]. Најновији подаци показују да је смртност и стопа инциденције од ХЦЦ-а у мојој земљи на трећем и четвртом месту међу свим малигним туморима, а има карактеристике брзог развоја и лаког рецидива [3-4]. Етиологија и патогенеза рака јетре су још увек нејасне. Његова појава може бити повезана са полиморфизмом гена домаћина, факторима средине (укључујући метаболички синдром и афлатоксин Б1), конзумацијом алкохола и вирусним факторима (укључујући инфекцију вирусом хепатитиса Б и хепатитисом Ц). ) везано за интеракцију [5]. Традиционална кинеска медицина може се користити за пацијенте са узнапредовалим ХЦЦ и има антитуморске ефекте, смањујући нежељене реакције радиотерапије и хемотерапије, побољшавајући имунитет туморских пацијената и побољшавајући квалитет живота [6]. Цистанцхе десертицола је врста биљке Оробанцхиацеае Цистанцхе цистанцхе Цистанцхе десертицолаИ. Ц. Ма или Цистанцхе туберосум Цистанцхе Цистанцхе. ЦХЕ ТУБУЛОСА (СЦХЕНК)

Осушене меснате стабљике са љускавим листовима Вајта [7] имају функцијехрањење бубрега, допуњавајућа суштина, и хидратантна

Има ефекат сушења и лаксатив. То је редак и вредан тоник лековити материјал јединствен за сушне области северозапада моје земље и има дугу историју примене. Цистанцхе десертицола је први пут забележена у „Материа Медици“ династије Источни Хан: „Укус је сладак и благо топао. Лечи пет врста порођаја и седам повреда. Храни средину, уклања хладноћу, топлоту и бол у стабљикама. , храни пет унутрашњих органа, јача јин, допуњује суштину и чи и помаже код порођаја, а женски синдром „Дуготрајна употреба ће олакшати тело“ и класификована је као врхунски фенилетаноидни гликозиди (8). фени⁃

Летаноид Глицосидес фром Цистанцхе, ЦПхГс) као Цистанцхес. Главни активни састојци у њему укључују вербаскозид, ехинацеазид, салидрозид, 2′-ацетил вербаскозид, тубулин Б, итд. [9], има функције заштите јетре, антидеменције, против умора, заштите од исхемије, анти-остеопорозе, лаксатива, имунолошке регулације, против старења и побољшања репродукције [10].

Студије су доказале да ЦПхГ имају добар ефекат у превенцији и лечењу рака јетре. Истраживање Иуан ет ал. [11] су показали да ЦПхГ инхибирају раст ћелија Х22 путем егзогених и ендогених путева апоптозе. Ху Кионг ет ал. [12] су открили да ЦПхГ могу инхибирати раст ћелија рака јетре, што може бити повезано са смањењем садржаја АФП-а у серуму мишева са тумором и побољшањем имунитета мишева са тумором. Тренутно не постоји детаљна студија о улози ЦПхГ у превенцији и лечењу ХЦЦ и његовом молекуларном механизму деловања, а његови активни састојци, циљеви деловања и молекуларни механизми још увек нису у потпуности разјашњени.

Мрежна фармакологија ажурира постојећи приступ „један циљ, један лек“ на истраживачки приступ „мрежни циљ-вишекомпонентни“, односно на овој основи спроводи свеобухватну анализу ефикасности традиционалне кинеске медицине и истражује традиционалну кинеску медицину. из системске перспективе и на молекуларном нивоу. , конструишући нове идеје за мрежну фармакологију традиционалне кинеске медицине [13-14]. Ова студија користи стратегије мрежне фармакологије и заснована на холистичком погледу традиционалне кинеске медицине да би систематски истражила механизам деловања ЦПхГ у превенцији и лечењу ХЦЦ. У комбинацији са мрежним моделом на више нивоа „ТЦМ⁃активни састојци⁃циља⁃сигнални путеви“, предвиђа се ефикасност ЦПхГ у превенцији и лечењу ХЦЦ. Кључни циљеви и механизми деловања верификовани су коришћењем молекуларне технологије спајања, а разрађен је синергистички механизам вишекомпонентних, вишеструких мета и вишеструких путева ЦПхГ, што је значајно унапредило област развоја медицинских ресурса ЦПхГ и обезбедило референца за наредна истраживања.

1 Материјали и методе

1.1 Збирка компоненти ЦПхГ

Претрагом базе података и платформе за анализу фармакологије система традиционалне кинеске медицине (Традитионал Цхинесе Систем Пхармацологи пхармацологи Датабасе анд Аналисис Платформ, ТЦМ СП), Енцицлопедиа оф Традитионал Цхинесе Медицине Датабасе (Енциклопедија традиционалне кинеске медицине) дивине, ЕТЦМ, ЕТЦМ Цомпретионал Цхинесе Медибасиве (Традиционална кинеска медицина И торнадо

база, ТЦЦМИД) и друге базе података и у комбинацији са националним подацима о инфраструктури знања

База података (Кинеска национална инфраструктура знања, Ц Релевантна литература у базама података НКИ и ПубМед коришћена је за прикупљање хемијског састава и циљних информација ЦПхГ. Претрагом у ТЦМСП, ЕТЦМ, ТЦМИД базама података и литератури, коначно је идентификовано 29 једињења.

Као кандидатска једињења [15-16].

1.2 Предвиђање потенцијалних терапеутских циљева лекова и конструкција мрежног дијаграма "ТЦМ-Активни састојак-Таргет"

Датотеке у формату СДФ преузетих компоненти су увезене у ПхармМаппер базу података да би се спровела предиктивна анализа потенцијалних циљева, а УниПрот КБ функција претраживања је коришћена за исправљање имена циљева. Цитосцапе 3. 8. 0 софтвер је коришћен за конструисање мрежног дијаграма „ТЦМ-Активни састојак-Таргет”.

1.3 Скрининг гена повезаних са ХЦЦ

Користите „Хепатоцелуларни карцином“ и „ХЦЦ“ као кључне речи за претрагу у следеће 4 базе података да бисте добили информације о циљаним ХЦЦ: 1) О МИМ база података; 2) база података ДругБанк; 3) база података ГенеЦардс; 4) База података о терапеутским циљевима (Тхерапеутиц Таргет Датабасе, ТТД, хттп://дб.и дрлаб.нет/ттд). Након скрининга, циљне информације се сумирају и организују.

1. 4 Циљно мапирање ЦПхГ за лечење ХЦЦ

Да бисте направили Ваинету путем софтвера за цртање на мрежи, циљ компоненте ЦПХГС је мапиран са ХЦЦ циљем. Циљ раскрснице је потенцијална мета ХЦЦ категорије ЦПХГС компоненте. Циљеви раскрснице болести.

1. 5. Конструкција интеракције протеина ５ протеина

(PROTEIN⁃PROTEIN Intere⁃ACTION, PPI) the network uses the STRING database: / / / / sTRING⁃DB. ORG /) for PPI analysis of the target. Set the COMBI NED SCORE>{{0}}. 4, и користите Цитосцапе 3. 8. 0 да извршите тополошку анализу резултата и издвојите кључне заједничке циљеве са вредношћу степена већом од 2 пута од медијане.

1.6 Анализа обогаћивања онтологије гена (ГО) и Кјото енциклопедија гена и генома (Кјото енциклопедија) иа. гена и генома, КЕГГ) анализа обогаћивања

База података ДАВИД је коришћена за извођење ГО анализе и анализе обогаћивања КЕГГ пута на циљним протеинима са којима су ЦПхГ и ХЦЦ заједнички ступили у интеракцију, а праг П мањи или једнак {{0}}.05 је постављен на скрининг издвојити биолошке процесе и путеве са значајним разликама и користити Ци⁃то ｓｃａｐｅ 3. 8.0 Софтвер конструише мрежу „ТЦМ⁃Ацтиве Ингредиентс⁃Таргетс⁃Патхваи”.

1.7 Верификација молекуларног спајања језгра мета Изаберите кључне циљне протеине

Бела је коришћена за молекуларно спајање. Датотеке кристалне структуре ових циљних протеина су добијене из базе података РЦСБПДБ. Датотеке структуре активних састојака ових мета су добијене из ПубЦхем базе података. Аутодоцк{0}}вина софтвер је коришћен за израчунавање односа између циљних протеина и Најниже енергије везивања између активних састојака и визуелизује резултате верификације симулације молекуларног спајања.